Bij de geboorte zijn er nog weinig verschijnselen aanwezig.
Op latere leeftijd hebben mensen met het Proteus-syndroom vaak kenmerkende afwijkingen in het gezicht, zoals een laag ingeplante neus, wijde neusgaten, een mond die in rust openhangt en een lang gezicht. Daarnaast wordt het Proteus syndroom gekenmerkt door overmatige of asymmetrische, ongelijke groei van verschillende delen van het lichaam.
Misvormingen kunnen onder andere optreden in de huid, het onderhuids weefsel (inclusief vet), het bindweefsel (botten en ligamenten), de hersenen en het ruggenmerg, en in de organen. Deze verschijnselen en afwijkingen komen echter niet allemaal bij dezelfde patiënt voor.
De ongelijke groei kan leiden tot:
- grote en asymmetrische schedel;
- misvormde handen en voeten;
- huidverdikkingen op de handpalmen en voetzolen;
- scoliose of kyfose (vergroeiing van de wervelkolom);
- tumoren onder de huid (vet en lymfklieren);
- verkleuringen op de huid en talrijke moedervlekken;
- volumevermeerdering van weefsel of organen in één lichaamshelft (hemihypertrofie);
- botwoekering, vooral in de gehoorgang;
- misvormingen van de bloedvaten.